1、创建与发展时期（1954年—1957年）

根据《地方各级人民检察署组织通则》的规定，吴川县人民检察院于1954年10月成立，李致信任副检察长（检察长空缺）。1956年3月和10月，分别增补柯英明、凌伟峰任副检察长。该时期开展了与职能相适应的业务活动。

2、削弱与取消时期（1958年—1977年）

1958年11月7日，吴川县与化县合并，吴川县人民检察院并入化州县人民检察院。1961年4月5日，吴川县与化州县分开，恢复吴川县人民检察院，周备森任副检察长（检察长空缺）。1967年1月，文化大革命造反派夺权，检察院被撤销，检察干部部分到“五·七”干校劳动，部分到吴川县革命委员会保卫组工作。

3、重建与发展时期（1978年—现在）

1978年3月，第五届全国人大第一次会议通过了中华人民共和国第三部宪法，决定重建检察院。1978年11月，吴川县人民检察院重新建立后，周备森任检察长，李和、龙植西任副检察长。1982年12月，张石清任副检察长。1984年5月，钟家智任检察长。1987年6月，林国雄任检察长。

1993年8月，罗鸿华任检察长。1995年8月，征用梅菉街道广江路东侧地皮一块，面积17832平方米，为办公、住宅用地，并取得了《国有土地使用证书》。该地块的征用，为今后的基本建设打下了基础。1996年1月25日，举行1995年度年终总结大会，检察长与副检察长均上台作全年述职报告，向全院干警报告一年的工作成绩与不足。这一举措是历史上第一次开了民主监督先河。

1999年11月，梁泉任检察长。2000年3月，开展“竞争上岗、双向选择”活动，全院27个中层领导职位实行公开竞争。中层干部确定后，院党组根据工作需要确定各科室的干警职数，由科长（主任）选科员，科员选择工作科室，实行双向选择。该竞争激励机制打破了论资排辈的用人制度，激发了干警的工作热情，有效调动了工作积极性。2001年11月，预算投资1000多万元、建筑面积10000多平方米的新业务技术大楼开始动工兴建。2003年被评为广东省先进检察院。

2003年3月，欧尚勇任检察长。2005年11月，总建筑面积10500多平方米、工程总投入1400多万元的业务技术大楼落成搬迁。2006年被最高人民检察院荣记集体一等功。2007年被评为广东省先进检察院，并被最高人民检察院授予“全国先进基层检察院”称号。

2008年8月，廖志胜任检察长。2009年被评为广东省先进检察院。2009年12月，被最高人民检察院确定为党组成员、政治部主任李如林在广东的基层检察院建设联系点。2011年2月18日，李如林主任在广东省人民检察院党组书记、检察长郑红和党组成员、政治部主任李小东陪同下到吴川市人民检察院调研。2011年4月，被广东省委、省人民政府授予“广州亚运会、亚残运会先进集体”称号。

2011年9月，李军任检察长。2012年9月，被广东省人民检察院授予“广东省检察机关文化建设示范单位”。2014年12月，建设的吴川市青少年法制教育基地被广东省依法治省办授予“广东法治文化建设示范点”。2015年，建设的“职工书屋”获中华全国总工会授牌匾。

2016年9月，梁广任检察长。2018年1月，因国家监察体制改革，我院反贪反渎等职能、机构、人员转隶至吴川市监察委员会。2020年1月，根据上级统一部署和要求，推进内设机构改革，共设有8个内设机构、1个派出机构和1个事业单位。

2021年9月，陈峰任代理检察长。